Sakura Kinomoto é uma estudante de 10 anos de idade, que mora na cidade de Tomoeda, no Japão. Acidentalmente ela abre um livro misterioso chamado Livro Clow, e desse livro saem 19 cartas mágicas. Porém, essas cartas são levadas por uma tempestade de vento passageira, que foi feita exatamente pela carta do vento quando Sakura leu seu nome.
O guardião das cartas, Kerberos, que parece um pequeno bicho de pelúcia, sai de dentro do livro, e conta a pequena Sakura que todas essas cartas foram espalhadas pela cidade, e é sua obrigação pega-las novamente, se tornando conhecida como CardCaptor!
Essas cartas obviamente não são como qualquer baralho por aí, elas tem habilidades especiais e causam estranhos fenômenos quando invocadas.